本日は、博士号を取得した臨床栄養士のブラッド・リーチ博士をお迎えします。マイクロバイオームの多様性を低下させる要因から、マイクロバイオームへのユーザーフレンドリーなアプローチまで、あらゆることを話し合います。リーチ博士が、HEXA-LPS の影響、多様な食事を摂ることの重要性、「リーキーガット」が本当かどうか、そして「善玉菌と悪玉菌」の新たな見方について語るこの洞察に満ちた会話にぜひご参加ください。この会話には、誰もが恩恵を受ける情報が満載です。

ブラッド・リーチ博士とは誰ですか?

ブラッド・リーチ博士は、アーユルヴェーダの薬草医学と栄養学のバックグラウンドを持つ、博士号を取得した臨床栄養士です。サプリメント会社や病理学会社で働いた経験があり、現在は臨床診療で腸の健康とマイクロバイオームの分野で患者を診察しています。マイクロバイオームを通じて腸の健康を改善し、腸内の環境を改善する方法に焦点を当てています。

彼は大学と共同でさまざまなコースを開発しており、現在は「Microba」の主任臨床教育者を務めています。そこでは、非常にエビデンスに基づいた実践的な観点から、マイクロバイオームを理解し、改善する方法を専門家や消費者に教育する役割を担っています。たとえば、1日に60グラムの食物繊維を摂取するよう勧める代わりに、膨満感や食事中の他の主要栄養素を犠牲にすることなく個人が耐えられるよう、30グラムを目標にすることができます。

マイクロバイオームに対するあなたの情熱は何から生まれたのですか?

伝統的なアーユルヴェーダ医学では、病気は腸から始まると信じられているため、消化器系に重点が置かれています。私の最初の教育は、消化器系の健康をサポートすることに重点が置かれていました。私は自己免疫疾患の研究を始め、優等学位や博士号取得に向けて進むにつれて、治療法を見つけたいと思いました。指導教官は、博士号取得中にすべての自己免疫疾患の治療法を見つけることはできないと私に言い聞かせ、自己免疫疾患に関しては小さな要素に焦点を当てるように言いました。

この時点で、私はピサーノ博士（タンパク質ゾヌリンを発見した）の論文に偶然出会いました。博士は、このタンパク質が腸管透過性の増加に寄与していることを発見しました。博士は、ゾヌリンの放出を調節し、腸管透過性を止めることで、自己免疫疾患の発症を阻止できると理論づけました。これが、腸の健康と腸管透過性という道へと私を導きました。私はこれについて博士号を取得しましたが、それは単にバリアの完全性の問題ではなく、腸内で起こるすべてのことに関係するという結論に達しました。

このとき、臨床医として、健康な腸がどのようなものであるかについては基本的な理解があるものの、研究を進めていくと、それははるかに複雑であり、マイクロバイオームを改善するには多くのことが必要であることに気付きました。

マイクロバイオームとは何ですか?

私たちの皮膚、肺、膣、腸にはマイクロバイオームが存在します。腸のマイクロバイオームには、口、胃、小腸、大腸が含まれます。大腸には、発酵が起こる場所であるため、マイクロバイオームの大部分が存在します。現在、28,000 種を超える細菌を測定し、配列することができます。10 ～ 15 年前は、腸の属種の中でほんの数種類の細菌しか調べていませんでしたが、今では理解が広がり、さらに多くの細菌がいることがわかっています。

個人の観点から見ると、腸内には一般に約 174 種の細菌が見られます。4,000 ～ 6,000 種の細菌を配列できますが、その数の細菌がいるとしたら、スーパーマンか重病人かのどちらかです。これをより現実的な視点で見ると、私は炎症性腸疾患の患者を診ていますが、彼らの腸内には 20 種の細菌しかいません (しかも、そのほとんどは有害です)。一方、ベジタリアンで、抗生物質や NSAID を服用したことがなく、経膣出産で、農場で育ち、私たちが探しているこれらの重要な条件をすべて満たしている私の腸には、約 250 種の細菌がいます。

西洋世界から一歩離れて他の微生物叢を見てみると、他の文化にはもっと多くの種が存在することがわかります。アフリカの部族の微生物叢には平均して 750 種の生物が存在するという論文に出会いました。

腸内多様性の減少を引き起こす要因

腸内の多様性を本当に低下させる要因がいくつかあります。

アルコール: 10 ～ 15 年後には、喫煙が慢性疾患の一因であるのと同じように、アルコールもみなされるようになると思います。アルコールはがんのリスクを高め、腸内細菌叢に影響を与えます。アルコールを大量に摂取すると、腸内細菌叢の多様性が低下し、腸の健全性と腸内環境に影響を及ぼします。
抗生物質、NSAID、さらには抗菌ハーブもマイクロバイオームの多様性に影響を及ぼす可能性があります。
繊維質の少ない食事:食事に十分な繊維質が含まれないと、腸内細菌叢は飢えてしまいます。腸内細菌叢は、微生物代謝物の発酵と有益な化合物の生成に繊維質を必要とします。繊維質が不足すると、腸内細菌叢は死滅し始めるか、腸内の粘液層にあるムチンを利用し始めます。
ハーブによる都市化:私たちは、牛や他の野生動物がいる田舎のコミュニティから離れようとしています。私はシドニーの小さなアパートで 5 年間過ごしましたが、そのせいで自分のマイクロバイオームが傷ついたことを実感しています。自然に出かけないことは、あなたに影響を与える可能性があります。私の患者の多様性が低い場合、私は彼らに自然に出かけ、庭仕事をし、手を汚すように言います。これはストレスを軽減することもできます。ストレスは私たちの闘争または逃走反応を引き起こし、消化酵素の放出に影響を与え、マイクロバイオームの生態系を減少させます。
食品に含まれる化学物質:グリホサートは、農作物や地元の庭に散布される、広く使用されている除草剤です。これらの化学物質は微量でも微生物叢の多様性を損ない、特定の種に影響を与えます。
食べ物に含まれる抗生物質:動物の筋肉量と体重を増やすために、肉には通常、大量の抗生物質が注入されます。
人工甘味料と保存料:これらは腸内細菌叢に非常に有害です。私たちの曽祖父母は、食品に含まれるこれらの化学物質にさらされることは決してありませんでした。
洗浄製品に含まれる化学物質:私たちは、洗浄製品、シャンプー、パーソナルヘルス製品から化学物質を摂取しています。

多様な植物性食品を摂取することの重要性

植物性食品にはそれぞれ異なるプレバイオティクスと食物繊維の独自の構成があることがわかっています。私たちのマイクロバイオームの異なる種は、異なるプレバイオティクス繊維を燃料源として利用します。毎日の食物繊維摂取量を満たしていても、毎日同じ食品から摂取していると、微生物の多様性が低下します。イヌリン、ベータグルカン、 GOS 、 FOS 、そしてさまざまな種類の植物性食品にその他さまざまなものが含まれています。私たちは毎週 30 種類の果物、野菜、ナッツ、種子、穀物を摂取する必要があります。

ポリフェノールも重要です。これらは、コーヒー、紅茶、ジュース、ハーブ、スパイスなどさまざまなものから摂取できます。したがって、これらを週 30 の摂取の一部として考えれば、達成するのはそれほど難しくありません。-クリベンゴベンダー

虹色の食べ物を食べるようにしてください。植物のすべての色とすべての部分を食べてください。植物の各部分には、微生物の多様性とマイクロバイオーム内の種の数をサポートするさまざまなポリフェノールとプレバイオティクス繊維が含まれています。

消化器系の問題を抱える患者への対応方法

私は研究に深く入り込み、試行錯誤しながら学んできました。2008年から患者を診ていますが、治療はゆっくり進めるように言われています。たとえば、オート麦や特定の種類の豆類が体に合わない人は、その理由をもっとよく理解する必要があります。それはSIBOのような症状なのでしょうか？もしそうなら、私たち自身の微生物叢と腸の能力で、腸のバランスを整える抗菌化合物を生成することができるのでしょうか？

コツは、ごく少量から始めることです。患者が耐えられることがわかったら、よく調理した缶詰の豆類を小さじ 1 杯加えるように伝えます。豆類をよく洗って、最初の 1 週間は数日おきに小さじ 1 杯から始めて、1 日 1 杯まで増やしていきます。2 週目は毎日小さじ 2 杯にします。これを実行する前に豆類に耐性がなく、一度に大量に摂取すると、下痢や便秘でお腹が張ってしまいます。少量ずつゆっくり摂取することが重要なのはこのためです。

マイクロバイオームと腸の健全性の治療

マイクロバイオームと腸の健全性を治療する際、私は複数の方法を同時に治療する相乗的アプローチを採用しています。腸の健全性はマイクロバイオームの影響を受け、その逆もまた同様であることが分かっています。そのため、1 つの要素または病気だけを治療しても、最良の結果は得られません。食事から誘因を取り除き、食物繊維をゆっくりと取り入れ、その後、リーキーガットまたは腸の透過性の向上（証拠がある場合）をサポートするために、標的療法を使用することができます。

15～20 年前、誰もが腸漏れ症候群にかかっていると騒がれていました。しかし、はっきりさせておきたいのは、そんなものは存在しないということです。症候群とは、その症候群を診断できる一連の臨床症状があることを意味しますが、実際には、私の研究では、腸漏れ症候群であると断言できる一連の臨床症状は存在しないことがわかっています。腸漏れ (腸管透過性の増加) は、小腸内で起こる反応です。したがって、腸内細菌叢と同時に腸漏れ症候群に対処することが非常に重要です。腸漏れ症候群と腸内細菌叢は互いに影響し合う可能性があるからです。

ヘキサLPS

LPS (リポ多糖類) は、一部の細菌の成分です。細菌によっては、細胞膜の外層にこれを持っています。HEXA-LPS と呼ばれるものに注目すると、これは LPS のサブグループで、炎症性が高く、慢性疾患に関連しています。これが、HEXA-LPS に注目する理由です。

腸内で吸収される HEXA-LPS が増加すると、全身性炎症の一因となる可能性があります。しかし、腸内では、HEXA-LPS は TR4 受容体を介して腸の炎症と透過性を誘発する可能性があります。HEXA -LPS 自体は腸の透過性と関連していますが、さまざまな種類の腸の炎症とも関連しています。

臨床的観点から、私たちはこの微生物代謝産物とマイクロバイオームからの産生を減らしたいと考えています。これは炎症性腸疾患などの健康状態に関連しており、この疾患を持つ人はマイクロバイオーム内にHEXA-LPS産生種が多く存在します。これを減らすことができれば、臨床症状の改善につながります。

腸の炎症、全身性炎症、そして痛み、膨満感、けいれんなどの腸の炎症の兆候を示す臨床症状。腸の炎症があると、微生物叢は不調になり、炎症を起こした腸内では善玉菌が繁殖できなくなります。

HEXA-LPS の主な推進力となる種は何ですか?

HEXA-LPS を生成できる菌種は数多くあり、大腸菌やクレブシエラ菌など、少なくとも 40～60 種が生成できます。特定の菌種を理解するだけでなく、全体として、マイクロバイオームがどのくらいの HEXA-LPS を生成しているかを把握することが重要です。菌種単独ではそれほど多く生成しないかもしれませんが、菌種が多数集まると、HEXA-LPS が豊富になります。

HEXA-LPS は健康な腸にとって懸念事項でしょうか?

これは、その値がどの程度高いかによって異なります。健康な集団で見られる値よりも高い場合、腸の炎症、全身性炎症、腸管透過性の増加を引き起こし、さまざまな慢性的な健康状態と関連している可能性があります。分岐鎖アミノ酸、IPA、TMAなど、さまざまな微生物代謝物があり、これらはすべてマイクロバイオームの一部です。しかし、HEXA-LPSは私が探す主なマーカーの1つです。

ヘキサLPS

HEXA-LPSへの取り組み方

以前なら、 「大腸菌がいるから、抗菌ハーブ、ベルベリン、オレガノオイル、またはその他のハーブを大量に与えて殺そう」と考えていたでしょう。しかし、この 2 年間で、抗菌ハーブの摂取がマイクロバイオーム全体に及ぼす影響を示す研究が発表されました。私は、ベルベリン 1000 ミリグラムを 3 か月間摂取した人では、酪酸産生細菌が減少し、HEXA-LPS 産生菌が増加したことを示す 2 つの研究論文に出会いました。

HEXA-LPS に関しては、抗菌剤を服用することは最も適切な処置とは言えません。そこで私はこのことについて考え、 「他にどのような介入策を講じることができるだろうか」と自問しました。脂肪比率をよりバランスよくし、飽和脂肪の摂取を減らし、オメガ 3 を多く摂取すると、腸から全身循環への HEXA-LPS の吸収が減ります。しかし、腸内には HEXA-LPS が残ります。

その後、ガラクトオリゴ糖（GOS）サプリメントを使用して、大腸菌を含むHEXA-LPS産生菌種を減らす研究に出会いました。この研究では、高齢者が3か月間4グラムのGOSを摂取しました。彼らは、HEXA-LPS産生菌種の減少が見られることを発見しました。したがって、LPSを「殺す必要がある」という観点から見るのではなく、 「微生物叢に栄養を与える必要がある」というアプローチだと考えています。腸内細菌叢を養うと、すでにそこにいる菌種をサポートして、それらを育て、有害な細菌を死滅させ、より多様で健康的でバランスのとれた微生物叢を得ることができます。

私の患者に GOS を処方すると、大多数の患者が敏感です。患者はさまざまな健康状態を抱えているため、低用量から始めることが重要です。私は通常、1 日 1 グラムから始めて、徐々に増やしていきます。1 週間は 1 グラム、次の 1 週間は 1 日 2 回 1 グラムに増やします。または、3 日間は 1 グラム、3 日間は 1 グラムずつ増やします。最初に大量に摂取すると、健康な微生物叢がない場合、膨満感が生じます。

さまざまなタイプの GOS の利点

ベータ GOS は、研究に基づいて臨床現場で効果があることが証明されています。市場で推奨されているプレバイオティクスには、サンファイバー部分加水分解グアーガムなどがあります。プレバイオティクス繊維の選択は、個人のマイクロバイオームに基づいて行う必要があります。

部分的に加水分解されたグアーガムは、特定の形質の生産をサポートし、特に便秘の臨床症状を緩和するのに役立ちます。腸に優しく、便のかさを増やし、蠕動運動をサポートします。便秘の患者に推奨される摂取量は、夜に約 10 グラムです。私は、多様性のために毎日のスムージーに少量加え、 GOSやHMOとともに、さまざまな種に与えています。pHGGは FODMAP に優しく、過敏症の人にも適しているため、ゆっくりと始めることが重要です。

マイクロバイオーム検査に関する技術

マイクロバイオームを測定する方法は、培養、16S、qPCR、メタゲノミクスなど、実に多岐にわたります。オーストラリアでは、マイクロバイオームを測定する方法の大半は培養qPCRとメタゲノミクスですが、英国と米国では16Sがより一般的に使用されています。

培養:私が臨床診療で培養を利用しない理由は、培養では微生物叢の約 5% しか測定できないからです。これは微生物叢が酸素にさらされるためですが、大腸には酸素がないことはわかっています。そのため、便のサンプルを採取して酸素にさらすと、カンジダなどの細菌が増殖し、誤った情報が得られます。

qPCR: Akkermansia muciniphila または streptococcus 属を調べたい場合。その量を正確に教えてくれますが、他に何が存在する可能性があるかは教えてくれません。qPCR 技術で使用できる「プローブ」は約 100 種類しかありませんが、ほとんどのマイクロバイオームレポートでは通常 20 ～ 30 種類の種が見られます。たとえば、qPCR とメタゲノミクスを比較すると、部屋で懐中電灯を使用するのと、スイッチをオンにしてすべてを見るのとでは似ています。

メタゲノミクス:これは細菌の DNA を調べて細菌を特定できるだけでなく、細菌が何を燃料源として利用しているか、どのような代謝産物を生成しているか、そしてそれらの機能も調べることができます。メタゲノミクスでは、HEXA-LPS を生成するさまざまな種をすべて調べ、遺伝子プロファイルに基づいてそれらを組み合わせて、 「この人のマイクロバイオームは HEXA-LPS を大量に生成できる」と判断できます。メタゲノミクスシーケンシングを使用して調べることができる微生物代謝産物には、HEXA-LPS、分岐鎖アミノ酸、IPA、TMA、メタン、硫化水素など、さまざまなものがあります。マイクロバイオームに誰がいるのかだけでなく、その機能を調べることができます。

マイクロバイオームを観察するユーザーフレンドリーな方法

腸内に存在する 184 種の細菌のリストを受け取ったら、 「この情報をどう扱えばいいのだろう」と考えてしまうでしょう。しかし、マイクロバイオームの機能について説明すれば、一歩引いて「xyz を減らすか増やすにはどうすればいいのだろう」と自問することができます。これは、圧倒されないようにするための、よりユーザーフレンドリーなアプローチです。私は 15 年間マイクロバイオームを研究してきましたが、まだすべての種を知っているわけではありません。すべての種について機能と治療法を知ることは、人間には不可能です。

私が目にするどのレポートにも、科学文献に一度も記載されたことのない種がいくつかありました。しかし、DNAとその機能を調べて、 「よし、短鎖脂肪酸を生産しているので、有益かもしれない」と言うことができます。これは、マイクロバイオームを調べる上で、臨床的に非常に役立つ方法です。

患者の便のプロファイルを見て、特定の病気の要素が見られる場合、どこに欠乏があるかを把握しておくと役立ちます。まずは良い点から始めて、次に欠乏について話し、食事やサプリメントを勧めるのは素晴らしいことです。これにより、ビタミン B を生成するマイクロバイオームなどのことも強調されるため、レベルが心配な場合はお金を節約できます。-Kriben Govender

マイクロバイオームは葉酸を含むさまざまなビタミンBを生成できることはわかっていますが、それらが全身に吸収されるかどうか、また、私たちがそれを利用できるかどうかについては、まだ研究が進んでいません。

抗菌薬がマイクロバイオームと機能的腸内細菌叢に与える影響

私は現在、2つの異なる分野に情熱を注いでいます。抗菌薬がマイクロバイオームに与える影響と機能的腸内細菌叢異常です。

長年、臨床医は患者に「あなたはディスバイオシスです」と伝えてきました。私はディスバイオシスの言い方を変えて、あなたは機能的ディスバイオシスであると言いたいのです。そしてそれはマイクロバイオームの機能に帰着します。ですから、私が「あなたは酪酸を生成する可能性が低い機能的ディスバイオシスです」と言うと、臨床医として、他の説明なしに単に「ディスバイオシス」と言うよりも、はるかに多くの情報が得られます。

そして、私が現在非常に興味を持っているもう一つの分野は、病原体と病原性共生菌、そして私たちのマイクロバイオーム内のそれらのバランスをどう治療するかということです。長年、私たちは腸内の病原体について、特定の種や属を見て「病原体があるから殺さなければならない」と考えてきました。しかし、本当の病原体は病原菌株であり、種ではありません。

病原菌株は医師の紹介が必要です。大腸菌株 01597 のような病原菌株に感染して急性下痢を起こしている人がいる場合、私はマイクロバイオームをサポートするためにプレバイオティクス繊維を試してみるつもりはありません。紹介状を書いてかかりつけ医に送り、その病原菌株を殺す抗生物質を入手します。

しかし、病原性寄生菌という概念があります。病原性寄生菌とは、健康に悪影響を及ぼす微生物種です。メタゲノム研究では、慢性疾患患者に特定の種が統計的に高いことがわかっています。それらは病原体ではありませんし、私たちはそれらを殺そうとしているわけではありませんが、横断的データからそれが病原性寄生菌であることがわかります。病原性寄生菌を病原体と同じように扱うことはできません。マイクロバイオームをサポートして養うだけでよいのです。誰かが私のところに来て、マイクロバイオームレポートにさまざまな病原性寄生菌が見つかった場合、私はそれらの多さを見て、それが問題を引き起こしているかどうかを確認します。その後、問題のさまざまな原因を理解し、原因を治療します。

例えば、連鎖球菌属には口腔基本種が存在する可能性があります。口腔基本種がより豊富に存在する場合、これらは病原性共生菌です。これらは口腔、鼻、喉、口に見られる種であり、便で特定されます。しかし、口内の細菌種は、肛門までの移動中、どのようにして生き残ることができるのでしょうか。これは、胃酸が不足しているためです。臨床医として、私はそのことを自分のツールベルトに入れて、 「この潜在的な連鎖球菌唾液種を殺そうとするのではなく、胃酸の生成を促進します」と言います。私は、胃酸の生成を促進するために、苦味ハーブ、リンゴ酢、消化酵素、塩酸、または亜鉛を使用するかもしれません。そうすれば、口腔種は腸内微生物叢で見つかりません。

病原菌の管理に関するもう 1 つの要素は、他の有益な細菌に栄養を与えることです。したがって、ベータグルカン (オート麦に含まれる) と発酵食品 ( 発酵野菜、ミルクケフィア、紅茶キノコなど) を食事に取り入れることは、腸内で病原菌が占めるスペースを少なくするために微生物叢に栄養を与える重要な戦略です。

私はこの新しいアプローチが大好きです。なぜなら、古いやり方は、核兵器で根幹を破壊し、ゼロからやり直すというものだったからです。生態系のすべてにおいて、野生の熱帯雨林に行って、すべてを核兵器で破壊し、ゼロからやり直そうとしたとしても、活気のある熱帯雨林に再生する可能性は極めて低いでしょう。複雑で、理解できないことがたくさんあるのです。 - クリベン・ゴベンダー

ブラストシスティスおよびジエントアメーバ・フラギリス寄生虫

腸内微生物叢に関する理解が進む前は、抗菌剤を使ってブラストシスティスを治療し、殺菌しようとしていました。これは良いことよりも悪いことの方が多かったと思います。今では微生物叢に関する理解が変わり、ブラストシスティスとD. フラジリスを生態系の一部として見ることができるようになりました。腸内環境が悪化し、影響を受けている場合にのみ問題が発生します。それらがそこにいるからといって問題があるわけではありません。私はD. フラジリスに感染していますが、腸にはまったく問題がありません。

ブラストシスティスをまだ心配している患者もいますが、一歩引いて腸内で他に何が起こっているかを見る必要があります。ストレスを感じていますか？排便は定期的に行われていますか？ブラストシスティスを原因として特定するのはやめましょう。私の経験から言うと、ブラストシスティスを殺すのは非常に難しく、微生物叢を危険にさらし、殺しても臨床症状に変化はありません。

私は現在、微生物を遺伝子と、代謝産物を生成するさまざまな遺伝子を持つ器官の一種として見ています。結局のところ、実際の利益は、微生物が生成する代謝産物から発揮されるか、さまざまな細菌、酵母、真菌、微生物が最終代謝産物へと連続して進化することによって発揮されます。したがって、特定の病原体、寄生虫、または病原性共生生物は、他の生物によって抑制されているか、一方が他方を餌とする連続進化の一部である可能性があります。私たちはよく善玉と悪玉を描こうとしますが、善玉は悪玉になる可能性があり、悪玉は善玉になる可能性があると私は考えています。 - クリベン・ゴベンダー

Microba 便検査はなぜ臨床現場で役立つのでしょうか?

機能検査は治療の方向性を知らせる必要があります。 「この検査の結果によって、患者の治療方法が変わります」と言える必要があります。腸内で何が起こっているかを知る必要があるため、私は臨床診療でマイクロバイオーム検査を活用しています。推測して何かを与えるのではなく、レポートに基づいて、マイクロバイオームの状態に基づいてカスタマイズされた薬を与えたいのです。

Rob Knights 16S から WGS への翻訳

16S は全ゲノムシーケンシングの前身であり、RNA をマーカーとして調べる安価で非常に高速かつ効果的なテストでした。しかし、現在、Rob は古い研究を調べて全ゲノムシーケンシングと照合する作業を行っています。以前は、16S の研究はすべて時代遅れで役に立たないと思っていましたが、この新しいデータが利用できるようになったことで、これらの研究をより統一された方法でまとめるのに役立ちます。全ゲノムシーケンシングはゴールドスタンダードであり、現代の企業はすべてこのテクノロジーを活用する必要があります。この分野がどのように進化していくのか楽しみです。-Kriben Govender

また、研究者が利用するデータベースによっても異なります。研究者が 16S やメタゲノミクスを使用できる場合もありますが、データベースが小さすぎて十分な情報が得られません。研究者がどのようなデータベースを使用しているかを理解するには、研究を深く掘り下げる必要があります。そうすることで、表面レベルのメタゲノミクスなのか、ディープメタゲノミクスなのかをより深く理解できるようになります。

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