Hari ini saya ditemani oleh ahli gizi klinis berkualifikasi PhD, Dr. Brad Leech. Kami berbicara tentang segala hal mulai dari faktor-faktor yang mengurangi keragaman mikrobioma hingga pendekatan yang mudah digunakan terhadap mikrobioma. Bergabunglah dengan kami dalam percakapan yang mendalam ini saat Dr. Leech berbagi tentang dampak HEXA-LPS, pentingnya mengonsumsi makanan yang beragam, apakah "usus bocor" itu nyata, dan cara baru untuk melihat bakteri usus "baik dan buruk". Percakapan ini penuh dengan informasi yang dapat bermanfaat bagi semua orang.

Siapakah Dr. Brad Leech?

Dr. Brad Leech adalah ahli gizi klinis berkualifikasi PhD dengan latar belakang pengobatan herbal dan nutrisi Ayurveda. Ia pernah bekerja dengan perusahaan suplemen dan patologi dan saat ini bekerja di praktik klinis yang menangani pasien di bidang kesehatan usus dan mikrobioma. Ia berfokus pada bagaimana kita dapat meningkatkan kesehatan usus melalui mikrobioma dan memperbaiki lingkungan di dalam usus.

Ia juga telah mengembangkan berbagai kursus bersama universitas dan saat ini ia adalah pendidik klinis utama di "Microba" di mana perannya meliputi mendidik praktisi dan konsumen tentang bagaimana kita dapat memahami dan meningkatkan mikrobioma dari perspektif yang sangat berbasis bukti tetapi praktis. Misalnya: alih-alih menyarankan seseorang untuk mengonsumsi 60 gram serat sehari, kita dapat menargetkan 30 sehingga individu tersebut dapat mentoleransinya tanpa kembung atau mengorbankan makronutrien lain dalam makanan mereka.

Apa yang Menumbuhkan Semangat Anda terhadap Mikrobioma?

Dalam pengobatan tradisional Ayurveda, mereka sangat menekankan pada sistem pencernaan karena mereka percaya bahwa penyakit bermula di usus. Pendidikan awal saya sangat terfokus pada dukungan kesehatan pencernaan. Saya mulai mendalami kondisi autoimun dan saat saya mendalami gelar kehormatan dan gelar doktor, saya ingin menemukan obatnya. Pembimbing saya mengingatkan saya bahwa saya tidak dapat menemukan obat untuk semua kondisi autoimun dalam gelar doktor, jadi mereka meminta saya untuk fokus pada satu elemen kecil dalam hal penyakit autoimun.

Pada titik ini, saya menemukan sebuah makalah oleh Dr. Pisano (yang menemukan protein Zonulin), dan ia menemukan bahwa protein itu berkontribusi terhadap peningkatan permeabilitas usus. Ia berteori bahwa kita dapat menghentikan perkembangan penyakit autoimun dengan memodulasi pelepasan Zonulin dan menghentikan permeabilitas usus ini. Hal ini membawa saya pada jalur kesehatan usus dan permeabilitas usus. Saya menempuh pendidikan Ph.D. secara menyeluruh tentang hal itu dan saya menyimpulkan bahwa hal itu bukan hanya tentang integritas penghalang, tetapi tentang segala hal yang terjadi di dalam usus.

Saat itulah saya menyadari bahwa sebagai dokter, kita memiliki pemahaman dasar tentang seperti apa usus yang sehat, tetapi saat Anda mendalami penelitian, Anda menyadari bahwa masalahnya jauh lebih rumit dan ada banyak hal yang perlu ditingkatkan untuk mikrobioma.

Apa itu Mikrobioma?

Kita memiliki mikrobioma di kulit, paru-paru, vagina, dan usus. Mikrobioma usus meliputi mulut, lambung, usus halus, dan usus besar. Usus besar merupakan tempat sebagian besar mikrobioma berada karena di sinilah fermentasi terjadi . Saat ini, kita dapat mengukur dan mengurutkan lebih dari 28.000 spesies bakteri yang berbeda. 10-15 tahun yang lalu, kita hanya mengamati beberapa selebritas usus dalam genus spesies dan sekarang setelah kita memiliki pemahaman yang lebih luas, kita tahu bahwa ada lebih banyak lagi.

Dari sudut pandang individu, kita secara umum dapat melihat sekitar 174 spesies berbeda di dalam usus. Kita dapat mengurutkan 4000-6000 spesies berbeda, tetapi jika Anda memiliki spesies sebanyak itu, Anda akan menjadi manusia super atau sangat sakit. Untuk menempatkan ini dalam perspektif yang lebih realistis, saya bekerja dengan pasien yang sakit dengan penyakit radang usus, yang hanya memiliki 20 spesies di usus mereka (dan sebagian besar spesies tersebut merugikan). Kemudian ketika Anda melihat usus saya, seseorang yang telah menjadi vegetarian, tidak pernah minum antibiotik, tidak pernah minum NSAID, lahir melalui vagina, tumbuh di pertanian, dan semua hal penting yang kami cari, saya memiliki sekitar 250 spesies.

Jika kita melangkah mundur dari dunia Barat dan mengamati mikrobioma lain, kita dapat melihat bahwa budaya lain memiliki lebih banyak spesies. Saya menemukan sebuah makalah yang menyatakan bahwa suku-suku di Afrika, rata-rata, memiliki 750 spesies dalam mikrobioma mereka.

Faktor-Faktor yang Mendorong Penurunan Keragaman Usus

Ada beberapa hal yang benar-benar menurunkan keragaman usus:

Alkohol: Saya yakin bahwa dalam 10-15 tahun ke depan, kita akan memandang alkohol dengan cara yang sama seperti kita memandang rokok sebagai faktor penyebab penyakit kronis. Alkohol meningkatkan risiko kanker dan memengaruhi mikrobioma kita. Jika kita mengonsumsi alkohol dalam jumlah besar, hal itu akan mengurangi keragaman mikrobioma dan memengaruhi integritas usus serta lingkungan di dalam usus kita.
Antibiotik, NSAID, dan bahkan herbal antimikroba dapat memengaruhi keragaman mikrobioma.
Pola makan rendah serat : Jika kita tidak memiliki cukup serat dalam makanan kita, mikrobioma kita akan kekurangan serat. Mikrobioma membutuhkan serat untuk fermentasi metabolit mikroba dan menghasilkan senyawa yang bermanfaat. Jika serat tidak mencukupi, mikrobioma akan mulai mati atau mulai menggunakan musin dengan lapisan lendir di dalam usus.
Urbanisasi herbal: Kita menjauh dari masyarakat pedesaan yang memiliki ternak dan hewan liar lainnya. Saya menghabiskan 5 tahun di Sydney di sebuah apartemen kecil dan saya tahu bahwa mikrobioma saya menderita karenanya. Tidak keluar ke alam dapat memengaruhi Anda. Ketika pasien saya memiliki keragaman yang rendah, saya meminta mereka untuk keluar ke alam, berkebun, dan mengotori tangan mereka. Ini juga dapat menurunkan stres. Stres memicu respons melawan atau lari kita yang memengaruhi pelepasan enzim pencernaan dan itu akan mengurangi ekosistem dalam mikrobioma kita.
Bahan kimia dalam makanan kita: Glifosat adalah herbisida yang sangat umum yang disemprotkan ke tanaman dan kebun setempat. Sejumlah kecil bahan kimia ini merusak keanekaragaman mikrobioma dan memengaruhi spesies tertentu.
Antibiotik dalam makanan kita: Daging biasanya diberi banyak antibiotik untuk meningkatkan massa otot dan berat hewan.
Pemanis buatan dan pengawet: Bahan-bahan ini sangat merusak mikrobioma usus. Kakek buyut kita tidak akan pernah terpapar bahan kimia ini dalam makanan kita.
Bahan kimia dalam produk pembersih kita: Kita berenang dalam bahan kimia dari produk pembersih, sampo, dan produk kesehatan pribadi kita.

Pentingnya Mengonsumsi Berbagai Jenis Makanan Nabati

Kita tahu bahwa setiap produk tanaman memiliki komposisi unik berupa prebiotik dan serat makanan yang berbeda. Spesies yang berbeda dalam mikrobioma kita akan menggunakan serat prebiotik yang berbeda sebagai sumber bahan bakar. Jika kita memenuhi asupan serat harian kita tetapi berasal dari makanan yang sama setiap hari, hal itu akan mengurangi keragaman mikroba. Kita memiliki inulin, beta-glukan, GOS , FOS , dan berbagai jenis makanan nabati lainnya. Kita harus mengonsumsi 30 jenis buah, sayuran, kacang-kacangan, biji-bijian, dan padi-padian setiap minggu.

Polifenol juga penting. Kita bisa memperolehnya dari berbagai jenis kopi, teh, jus, herba, dan rempah. Jadi, jika Anda menganggapnya sebagai bagian dari menu harian Anda, tidak akan sulit untuk memenuhinya. -Kriben Govender

Pastikan Anda mengonsumsi warna-warni pelangi. Makanlah setiap warna dan setiap bagian tanaman. Setiap bagian tanaman memiliki polifenol dan serat prebiotik yang berbeda yang akan mendukung keragaman mikroba dan jumlah spesies yang ditemukan dalam mikrobioma Anda.

Cara Menangani Pasien dengan Masalah Pencernaan

Saya telah mendalami penelitian ini dan juga belajar melalui coba-coba. Saya telah menangani pasien sejak 2008 dan telah diingatkan untuk menjalani pengobatan secara perlahan. Misalnya : jika seseorang tidak dapat mentoleransi gandum atau jenis kacang-kacangan tertentu, kita perlu memahami lebih baik alasannya. Apakah ini gambaran tipe SIBO? Dan jika ya, dapatkah kita mendukungnya dengan mikrobioma dan kemampuan usus kita sendiri untuk menghasilkan senyawa antimikroba guna menyeimbangkan usus?

Lalu triknya adalah memulai dengan dosis yang sangat rendah. Begitu saya menyadari mereka dapat menoleransinya, saya meminta mereka untuk menambahkan satu sendok teh kacang-kacangan kalengan yang dimasak dengan sangat baik. Cuci bersih lalu pada minggu pertama, mulailah dengan satu sendok teh setiap beberapa hari dan kemudian tingkatkan hingga satu sendok teh sehari. Lalu pada minggu kedua, tambahkan 2 sendok teh setiap hari. Jika Anda tidak toleran terhadap kacang-kacangan sebelum melakukan ini dan Anda menambahkan banyak sekaligus, Anda akan berakhir dengan kembung disertai diare atau sembelit. Inilah sebabnya mengapa penting untuk mengurangi dosis dan perlahan-lahan.

Mengobati Mikrobioma dan Integritas Usus

Saat menangani mikrobioma dan integritas usus, saya menggunakan pendekatan sinergis, yaitu menangani beberapa jalur sekaligus. Kita tahu bahwa integritas usus dipengaruhi oleh mikrobioma dan sebaliknya, jadi jika kita hanya menangani satu elemen atau penyakit, hasilnya tidak akan maksimal. Kita menghilangkan pemicu dari pola makan, perlahan-lahan memasukkan serat makanan, lalu kita dapat menggunakan terapi terarah untuk mengatasi usus bocor atau peningkatan permeabilitas usus (jika ada buktinya).

15-20 tahun yang lalu ada kehebohan tentang semua orang yang mengalami sindrom usus bocor. Namun, saya ingin mengklarifikasi, tidak ada hal seperti itu. Sindrom mengacu pada fakta bahwa ada sekelompok gejala klinis yang dapat mendiagnosis sindrom tersebut, padahal, penelitian saya menunjukkan bahwa tidak ada sekelompok gejala klinis yang menunjukkan adanya sindrom usus bocor. Usus bocor (peningkatan permeabilitas usus) adalah reaksi yang terjadi di dalam usus halus. Jadi, sangat penting untuk mengatasinya bersamaan dengan mikrobioma karena keduanya dapat memengaruhi satu sama lain.

HEXA-LPS

LPS (lipo polisakarida) merupakan komponen dari beberapa bakteri. Beberapa bakteri memiliki komponen ini di lapisan luar membran selnya. Kita dapat melihat sesuatu yang disebut HEXA-LPS, yang merupakan subkelompok LPS yang lebih bersifat inflamasi dan terkait dengan penyakit kronis. Inilah sebabnya kami fokus pada HEXA-LPS.

Kita dapat mengalami peningkatan penyerapan HEXA-LPS di dalam usus, yang dapat menyebabkan peradangan sistemik. Namun, di dalam usus, HEXA-LPS dapat menyebabkan peradangan dan permeabilitas usus melalui reseptor TR4. HEXA-LPS itu sendiri terkait dengan permeabilitas usus tetapi juga dengan berbagai jenis peradangan usus.

Dari sudut pandang klinis, kami ingin mengurangi metabolit mikroba dan produksi dari mikrobioma ini. Hal ini terkait dengan kondisi kesehatan seperti penyakit radang usus dan orang yang memiliki kondisi tersebut memiliki kelimpahan spesies penghasil HEXA-LPS yang lebih tinggi dalam mikrobioma mereka. Jika kita dapat menguranginya, hal ini dapat menghasilkan perbaikan gejala klinis.

Peradangan usus, peradangan sistemik, dan gejala klinis, seperti nyeri, kembung, dan kram pada semua tanda peradangan usus. Ketika terjadi peradangan usus, mikrobioma tidak senang dan spesies yang baik tidak dapat berkembang biak di usus yang meradang.

Spesies Apa Penggerak Utama HEXA-LPS?

Ada banyak spesies berbeda yang dapat memproduksi HEXA-LPS seperti: E. coli dan Klebsiella, setidaknya ada 40-60 spesies yang dapat memproduksinya. Yang perlu dipahami bukan hanya spesies tertentu tetapi juga secara kolektif, berapa banyak HEXA-LPS yang diproduksi oleh mikrobioma Anda? Karena spesies itu sendiri mungkin tidak memproduksi sebanyak itu, tetapi ketika jumlahnya banyak, di situlah terdapat kelimpahan HEXA-LPS.

Apakah HEXA-LPS Menjadi Masalah pada Usus yang Sehat?

Hal ini bergantung pada seberapa tinggi kadarnya. Jika kadarnya lebih tinggi dari yang kita lihat pada kelompok sehat, maka kadarnya dapat menyebabkan radang usus, radang sistemik, peningkatan permeabilitas usus, dan dikaitkan dengan beberapa kondisi kesehatan kronis yang berbeda. Ada begitu banyak metabolit mikroba yang berbeda, Anda dapat melihat seperti: asam amino rantai cabang, IPA, dan TMA, yang semuanya merupakan bagian dari mikrobioma kita. Namun, HEXA-LPS adalah salah satu penanda utama yang saya cari.

HEXA-LPS

Cara Menangani HEXA-LPS

Dulu, kita mungkin berpikir , "Baiklah, ada E. coli, kita akan memberikan ramuan antimikroba, berberin dosis tinggi, minyak oregano, atau ramuan lain untuk membunuhnya." Dalam dua tahun terakhir, penelitian telah menunjukkan dampak mengonsumsi ramuan antimikroba pada seluruh mikrobioma. Saya menemukan 2 makalah penelitian yang menunjukkan bahwa mereka yang mengonsumsi suplemen Berberin sebanyak 1000 miligram selama tiga bulan, mengalami penurunan bakteri penghasil butirat dan peningkatan spesies penghasil HEXA-LPS.

Mengonsumsi anti-mikroba bukanlah tindakan yang paling tepat untuk HEXA-LPS. Jadi saya memikirkan hal ini dan bertanya pada diri sendiri, "Intervensi apa lagi yang dapat kita gunakan?" Kita dapat memiliki rasio lemak yang lebih seimbang dan mengonsumsi lebih sedikit lemak jenuh, mengonsumsi lebih banyak omega tiga, yang akan mengurangi penyerapan HEXA-LPS dari usus ke dalam sirkulasi sistemik. Namun, masih akan ada HEXA-LPS di dalam usus.

Kemudian saya menemukan sebuah penelitian yang menggunakan suplementasi Galacto-oligosaccharides (GOS) untuk mengurangi spesies penghasil HEXA-LPS termasuk e.coli. Penelitian ini melibatkan individu lanjut usia yang mengonsumsi 4 gram GOS selama tiga bulan. Mereka menemukan bahwa ada pengurangan spesies penghasil HEXA-LPS. Jadi daripada melihat LPS dari sudut pandang "kita perlu membunuhnya" , saya menganggapnya sebagai pendekatan "kita perlu memberi makan mikrobioma" . Ketika kita memelihara jaringan usus, kita mendukung spesies yang sudah ada untuk memeliharanya dan membesarkannya, lalu bakteri yang merugikan dapat mati dan Anda memiliki mikrobioma yang lebih beragam, sehat, dan seimbang.

Ketika meresepkan GOS untuk pasien saya, sebagian besar dari mereka sensitif. Mereka memiliki berbagai kondisi kesehatan yang berbeda, jadi memulai dengan dosis rendah adalah kuncinya. Saya biasanya mulai dengan satu gram sehari dan meningkatkannya secara bertahap. Saya mungkin mengonsumsi satu gram selama seminggu, lalu meningkatkannya menjadi satu gram dua kali sehari selama minggu berikutnya. Atau saya akan mengonsumsi satu gram selama tiga hari dan meningkatkannya satu gram selama tiga hari. Menambahkan banyak dosis pada awalnya akan menyebabkan kembung jika Anda tidak memiliki mikrobioma yang sehat.

Manfaat Berbagai Jenis GOS

Berdasarkan penelitian, Beta GOS telah terbukti efektif dalam pengaturan klinis. Beberapa prebiotik yang direkomendasikan di pasaran termasuk gum guar yang dihidrolisis sebagian dari sunfiber . Pemilihan serat prebiotik harus didasarkan pada mikrobioma individu.

Gum guar yang terhidrolisis sebagian bermanfaat untuk mendukung produksi sifat-sifat tertentu dan meringankan gejala klinis, terutama untuk sembelit. Gum ini lembut di usus dan membantu menambah tinja serta mendukung gerak peristaltik dan motilitas. Dosis yang disarankan untuk pasien sembelit adalah sekitar 10 gram di malam hari. Saya memasukkan sejumlah kecil ke dalam smoothie harian untuk keragaman, bersama dengan GOS dan HMO untuk memberi makan berbagai spesies yang berbeda . Penting untuk memulai secara perlahan dengan pHGG, karena ramah FODMAP dan cocok untuk mereka yang sensitif!

Teknologi Seputar Pengujian Mikrobioma

Ada banyak cara berbeda untuk mengukur mikrobioma: melalui kultur, 16S, qPCR, dan metagenomik. Di Australia, sebagian besar cara untuk mengukur mikrobioma adalah kultur qPCR dan metagenomik, sedangkan di Inggris dan AS, 16S lebih mudah digunakan.

Kultur: Alasan saya tidak menggunakan kultur dalam praktik klinis adalah karena kultur hanya mampu mengukur sekitar 5% mikrobioma. Ini karena mikrobioma terpapar oksigen dan kita tahu bahwa tidak ada oksigen di usus besar kita. Jadi, jika kita mengambil sampel tinja dan memaparkannya pada oksigen, maka kita akan menumbuhkan bakteri seperti Candida dan hal itu memberi kita informasi yang salah.

qPCR: Jika Anda ingin mencari genus Akkermansia muciniphila atau streptococcus. Sangat akurat dalam memberi tahu Anda berapa banyak yang ada di sana tetapi tidak memberi tahu Anda apa lagi yang mungkin ada di sana. Hanya ada sekitar 100 "probe" berbeda yang digunakan dalam teknologi qPCR tetapi dalam sebagian besar laporan mikrobioma, Anda biasanya melihat 20-30 spesies berbeda. Misalnya, jika kita membandingkan qPCR dengan metagenomik, itu seperti menggunakan senter di dalam ruangan dibandingkan menyalakan sakelar dan melihat semuanya.

Metagenomik: Ini melihat DNA bakteri dan kemudian kita dapat mengidentifikasinya tetapi juga melihat apa yang digunakannya sebagai sumber bahan bakar, metabolit apa yang dihasilkannya, dan fungsinya. Dengan metagenomik, kita dapat melihat semua spesies penghasil HEXA-LPS yang berbeda dan menggabungkannya berdasarkan profil genetik untuk mengatakan, "Mikrobioma orang ini dapat menghasilkan banyak HEXA-LPS." Ada berbagai metabolit mikroba lain yang dapat kita lihat menggunakan pengurutan metagenomik termasuk: HEXA-LPS, asam amino rantai cabang, IPA, TMA, metana, dan hidrogen sulfida. Kita dapat melihat fungsi mikrobioma alih-alih hanya siapa yang ada di sana.

Cara Mudah untuk Melihat Mikrobioma

Jika Anda mendapatkan daftar 184 spesies yang ada di usus Anda, Anda akan berpikir, "Apa yang harus saya lakukan dengan informasi ini?" Namun, jika saya memberi tahu Anda fungsi mikrobioma Anda, Anda dapat mundur sejenak dan bertanya pada diri sendiri, "Bagaimana cara mengurangi atau meningkatkan xyz?" Ini lebih merupakan pendekatan yang mudah digunakan sehingga Anda tidak kewalahan. Saya telah mempelajari mikrobioma selama 15 tahun dan saya masih belum mengetahui setiap spesies. Tidak mungkin bagi manusia untuk mengetahui fungsi dan pengobatan setiap spesies.

Dalam setiap laporan yang saya baca, beberapa spesies tidak pernah didokumentasikan dalam literatur ilmiah. Namun, kita dapat melihat DNA dan fungsinya dan berkata , "Baiklah, ia menghasilkan asam lemak rantai pendek sehingga bisa bermanfaat." Ini adalah cara yang lebih bermanfaat secara klinis untuk melihat mikrobioma.

Ketika saya melihat profil tinja pasien dan unsur-unsur penyakit tertentu yang ada, ada baiknya untuk memahami di mana kekurangannya. Sangat bagus untuk memulai dengan kemenangan dan kemudian membicarakan kekurangannya dan membuat rekomendasi diet atau suplemen. Ini juga menyoroti hal-hal seperti mikrobioma yang menciptakan vitamin B sehingga Anda dapat menghemat uang jika Anda khawatir tentang kadar vitamin B Anda. -Kriben Govender

Kita tahu bahwa mikrobioma dapat menghasilkan sejumlah vitamin B yang berbeda, termasuk folat, tetapi penelitian di luar sana tentang apakah mereka diserap secara sistemik, dan apakah kita dapat memanfaatkannya, masih belum dipahami.

Dampak Antimikroba pada Mikrobioma dan Disbiosis Fungsional

Saat ini saya sangat tertarik dengan dua bidang berbeda: Dampak antimikroba pada mikrobioma dan disbiosis fungsional.

Selama bertahun-tahun, dokter telah mengatakan "Anda mengalami disbiosis" kepada pasien mereka. Saya ingin mengubah cara kita menyebut disbiosis dan mengatakan bahwa Anda mengalami disbiosis fungsional. Dan itu kembali pada fungsi mikrobioma. Jadi jika saya mengatakan " Anda mengalami disbiosis fungsional dengan potensi rendah untuk menghasilkan butirat", itu memberi Anda sebagai dokter lebih banyak informasi daripada sekadar mengatakan "disbiosis" tanpa penjelasan lain.

Lalu bidang lain yang cukup menarik perhatian saya saat ini adalah patogen dan patobion serta bagaimana kita dapat mengatasi keseimbangannya dalam mikrobioma kita. Selama bertahun-tahun, kita memiliki pemahaman tentang patogen dalam usus kita, di mana kita akan mengamati spesies atau genus tertentu dan berkata, "Saya punya patogen, saya harus membunuhnya." Namun, patogen sejati adalah galur patogen, BUKAN spesies.

Strain patogenik memerlukan rujukan medis. Ketika seseorang memiliki strain patogenik seperti strain E. coli 01597, yang menyebabkan diare akut. Saya tidak akan bermain-main dengan serat prebiotik untuk mendukung mikrobioma. Saya akan menulis rujukan dan mengirimkannya ke dokter umum untuk mendapatkan antibiotik guna membunuh strain patogenik tersebut.

Namun, ada konsep patobion. Patobion adalah spesies mikroba yang dikaitkan dengan dampak kesehatan yang negatif. Dalam penelitian metagenomik, kami melihat spesies tertentu secara statis lebih tinggi pada mereka yang menderita penyakit kronis. Mereka bukanlah patogen dan kami tidak mencoba untuk membunuh mereka, tetapi kami dapat melihat melalui data lintas bagian bahwa mereka adalah patobion. Kami tidak dapat memperlakukan patobion sama seperti patogen, Anda hanya perlu mendukung dan memelihara mikrobioma. Jika seseorang datang kepada saya dan dalam laporan mikrobioma mereka memiliki berbagai patobion yang berbeda, saya akan melihat kelimpahannya dan melihat apakah mereka menyebabkan masalah. Kemudian saya akan memahami berbagai penyebab masalah dan mengobati penyebabnya.

Misalnya: Genus Streptococcus dapat memiliki spesies dasar oral. Sekarang ketika ada kelimpahan spesies dasar oral yang lebih tinggi, ini adalah patobion. Mereka adalah spesies yang ditemukan di rongga mulut, hidung, tenggorokan, dan mulut Anda, dan kemudian mereka diidentifikasi dalam tinja Anda. Tetapi bagaimana spesies bakteri di mulut Anda dapat bertahan hidup selama transit ini ke anus Anda? Ini karena ada kekurangan asam lambung. Sebagai seorang dokter, saya menggunakan itu di sabuk peralatan saya untuk mengatakan "Daripada mencoba membunuh spesies air liur streptokokus potensial ini, saya akan mendukung mereka dengan produksi asam lambung mereka." Saya mungkin melakukannya dengan herba pahit, cuka sari apel, enzim pencernaan, asam klorida, atau seng, untuk mendukung produksi asam lambung. Maka spesies oral tidak akan ditemukan dalam mikrobioma usus.

Faktor lain dalam hal pengelolaan patobion adalah memberi makan bakteri bermanfaat lainnya. Jadi, memasukkan beta-glukan (yang ditemukan dalam gandum) dan makanan fermentasi (seperti sayuran fermentasi , kefir susu , atau kombucha ) ke dalam makanan Anda, adalah strategi utama untuk memberi makan mikrobioma sehingga patobion ini tidak akan menghabiskan banyak ruang di usus kita.

Saya suka pendekatan baru ini karena cara lama adalah dengan menghancurkan bagian dalam dan memulai lagi dari awal. Bila Anda melihatnya seperti di ekosistem mana pun, jika kita pergi ke hutan hujan liar, menghancurkan semuanya, dan mencoba memulai lagi dari awal, sangat tidak mungkin hutan hujan itu akan tumbuh kembali menjadi hutan hujan yang semarak. Ada begitu banyak kerumitan dan hal-hal yang tidak kita pahami. - Kriben Govender

Parasit Blastocystis dan Dientamoeba Fragilis

Sebelum kita memiliki pemahaman yang lebih mendalam tentang mikrobioma usus, kita ingin mengobati blastocystis dengan antimikroba sehingga kita dapat mengobati dan membunuhnya. Saya yakin hal ini lebih banyak menimbulkan kerugian daripada manfaat. Sekarang dengan adanya perubahan dalam pemahaman tentang mikrobioma, kita sebenarnya dapat melihat blastocystis dan D. fragilis sebagai bagian dari ekosistem. Masalah hanya terjadi ketika lingkungan dalam usus terganggu dan terkena dampak. Hanya karena mereka ada di sana bukan berarti ada masalah. Saya menderita D. fragilis dan tidak memiliki masalah usus sama sekali.

Saya tahu beberapa pasien yang masih khawatir dengan blastocystis mereka, tetapi kita perlu mundur sejenak dan melihat apa lagi yang terjadi di usus: apakah mereka stres? Apakah mereka buang air besar secara teratur? Jangan coba-coba mencari tahu blastocystis sebagai penyebabnya karena dari pengalaman saya, mencoba membunuhnya sangat sulit, akan membahayakan mikrobioma, dan ketika Anda membunuhnya, tidak ada perubahan pada gejala klinis.

Sekarang saya melihat mikroba sebagai genetika dan bentuk organ dengan gen berbeda yang menghasilkan metabolit. Pada akhirnya, manfaat sebenarnya diberikan baik dari metabolit yang mereka hasilkan atau dari rangkaian bakteri, ragi, jamur, dan mikroba yang berbeda, hingga metabolit akhir. Jadi patogen, parasit, atau patobion tertentu mungkin dikendalikan oleh organisme lain atau mereka mungkin menjadi bagian dari rangkaian di mana satu memakan yang lain. Kita sering mencoba dan menggambarkan orang baik dan orang jahat, tetapi saya pikir orang baik bisa menjadi jahat, dan orang jahat bisa menjadi baik. - Kriben Govender

Mengapa Pengujian Tinja Mikroba Berguna dalam Pengaturan Klinis?

Pengujian fungsional perlu memberikan informasi tentang arah pengobatan. Kita perlu dapat mengatakan , "Hasil pengujian ini akan mengubah cara saya merawat pasien saya." Itulah sebabnya saya menggunakan pengujian mikrobioma dalam praktik klinis saya karena saya perlu mengetahui apa yang terjadi di usus. Saya tidak ingin hanya menebak dan memberi Anda sesuatu, saya ingin mendasarkannya pada laporan dan memberi Anda pengobatan yang dipersonalisasi berdasarkan apa yang dilakukan mikrobioma Anda.

Terjemahan Rob Knights 16S ke WGS

16S adalah pendahulu untuk pengurutan genom secara keseluruhan. Ini adalah uji yang murah, sangat cepat, dan efektif yang melihat RNA sebagai penanda. Namun kini Rob telah melakukan beberapa pekerjaan di mana mereka dapat melihat penelitian lama dan mencocokkannya dengan pengurutan genom secara keseluruhan. Sebelumnya saya mengira bahwa semua 16S akan menjadi sampah dan ketinggalan zaman, tetapi sekarang dengan data baru yang tersedia, ini membantu menyatukan penelitian ini dengan cara yang lebih terpadu. Pengurutan genom secara keseluruhan adalah standar emas dan setiap perusahaan modern harus memanfaatkan teknologi itu. Saya bersemangat untuk melihat bagaimana bidang itu berkembang. -Kriben Govender

Hal ini juga bergantung pada basis data yang mereka gunakan. Terkadang peneliti dapat menggunakan 16S atau metagenomik, tetapi basis data mereka sangat kecil dan tidak akan memberi Anda informasi yang cukup. Anda harus menyelami penelitian secara mendalam untuk memahami basis data apa yang mereka gunakan dan hal itu akan memberi Anda pemahaman yang lebih kuat apakah itu metagenomik tingkat permukaan atau metagenomik tingkat dalam.

Pastikan untuk terhubung dengan Dr. Brad Leech melalui situs webnya dan bagikan ini dengan teman yang dapat memperoleh manfaat dari informasi ini!